Корень хрена содержит витамины группы В1, В2, В3, В6, С, РР.
Аскорбиновой кислоты больше, чем в листьях. Также присутствует много клетчатки, эфирных масел, фолиевой кислоты, фитонцидов, лизоцима, горчичное аллиловое масло, гликозид синиргин, кумарины, флавоноиды, сапонины, соли калия, фосфора, натрия, железа, магния, кальция, калий, сера.